1.增加排便防

由于双歧杆菌发酵低聚糖产生大量的短链脂肪酸能刺激，增加粪便的湿润度，并通过菌体的大量生长以保持一定的渗透压，从而的发生。此外，低聚糖属于水溶性膳食纤维，可促进小，也能预防和减轻便秘。

2.生成营养物质、增加营养吸收

功能性低聚糖可以促进双歧杆菌增殖，而双歧杆菌可在内合成维生素B1 、B2 、B6 、B12 、烟酸、叶酸等营养物质。此外，由于双歧杆菌能抑制某些维生素的分解菌，从而使维生素的供应得到保障，如它可以抑制分解维生素B1的解硫胺素的芽孢杆菌，随着双歧杆菌的增殖，内合成的维生素含量会随之提高，可以间接提高人体内水溶维生素的摄入量和营养物质的吸收。

3.和胆固醇代谢

由于功能性低聚糖是难消化性糖，不能被消化酶消化吸收，一般较少转化成脂肪。它被双歧杆菌分解产生的丙酸又能抑制肝脏胆固醇的生成，分解产生的乙酸盐能抑制肝脏中葡萄糖转化成脂肪。摄入功能性低聚糖后可以胆固醇的水平，双歧杆菌产生的胆酸水解酶将结合胆酸游离出来，胆汁酸可以同胆固醇结合沉淀随大便排出体外，从而有效地。