焦亚硫酸钠是一种常用的食品添加剂，广泛应用于食品工业。目前我国在浅色蔬菜的加工和保鲜过程中常使用焦亚硫酸钠，如脱水马铃薯、蘑菇、紫菜、海带等的干制，还有竹笋、酸菜和蘑菇罐头等。在饼干工业中用焦亚硫酸钠作为饼干面团改良剂，美国人也会在面团中加入焦亚硫酸钠，靠释放的二氧化硫来削弱面团的筋力作用，从而改善面团特性，生产高质量硬质半甜、甜饼干和一些好吃的咸味零食饼干。在烤面包时加入适当的焦亚硫酸钠，不仅可以降低烘烤温度，而且能减小美拉德反应（一种在面包生产中普遍存在的非酶褐变现象）的速率，从而使得面包表面有明亮的颜色，也能够减少羟甲基糠醛和丙烯酰胺等有毒的中间体产生。在中国市场上，常常能见到在话梅、杨梅、红枣等水果干以及果蔬汁、酿造酒和饮料中添加焦亚硫酸钠用来做防腐剂，或者作为一些新鲜水果贮存的保鲜剂。在西方还常使用焦亚硫酸钠和柠檬酸来处理小龙虾，能提高小龙虾的感官质量，并且可在此基础上采取一定的方法改善小龙虾的保质期。加拿大则将焦亚硫酸钠作为固色剂及防腐剂用于海螺罐头。而中国虽然食品添加剂使用标准中没有规定可用于肉类产品，但是仍然有很多不法商贩在经济利益的驱使下，超量使用价格便宜的“洗虾粉”(主要成分焦亚硫酸钠）来处理小龙虾、海捕虾，代替了FMP-虾蟹用天然护色保鲜剂、食为鲜-虾鲜宝、植酸等都不含二氧化硫的保鲜剂。