1.促进动物内有益菌的繁殖，抑制有害菌生长，改善微生物菌群平衡。

由于低聚木糖不会被消化酶所降解并可携带病原体通过，因此可以起到防止病原菌定值的作用。病原菌不能利用甘露低聚木糖作为供其生长的能量来源，而有益菌如乳酸杆菌和双歧杆菌等可以被甘露低聚木糖激活。故低聚木糖通过双歧杆菌等有益菌间接发挥作用。

同时有益菌产生的代谢产物短链脂肪酸能刺激，缩短食糜在肠内的停留时间，从而减少有害物质对动物机体造成的毒害。

2.阻断病原菌与宿主细胞受体的结合。

低聚木糖可竞争性的和病原细胞表面外源凝集素结合，阻碍病原菌在上皮黏附，促使其随粪便排泄，减少对动物的危害。低聚木糖还可以通过物理吸附或直接结合霉菌毒素等形式，消除毒素对机体的有害影响。

3.刺激动物机体的，。

低聚木糖可激活或促进机体细胞和体液的，有利于机体免受致病菌微生物的侵袭和损害。有益菌还具有激活机体细胞内超氧化岐化酶（SOD）、过氧化氢酶和谷胱甘肽过氧化物酶的作用，促使抗氧化物产生。减少自由基的损伤。对动物起着强身健体的作用。低聚木糖在激活免疫应答上也有一定的作用。由于源自微生物的特殊多糖在加入疫苗时具有佐剂作用，因而添加适量的低聚木糖还可提高抗体反应能力，从而加强疫苗的保护效能。