在日本，日本明治制果公司中央研究所做的关于低聚果糖的安全性实验已经证明了低聚果糖是安全性的。1995年厚生省批准低聚果糖为“特定保健用食品”。在欧洲，低聚果糖和菊粉已被批准为食品配料，不需按使用食品添加剂那样事先报审才能使用。在美国，生产厂家与美国官方化学家协会（ACAC）合作，已于1997年底经官方食品和药品管理局（FDA）批准，低聚果糖被列为“膳食纤维源”确定为“膳食补充剂”在市场销售。在我国，云南天元生产的低聚果糖经中国指定的科研机构完成的多项安全性毒理学试验和评价，卫生学和稳定性试验等。结果表明：云南天元低聚果糖食用是安全的、的。酶法生产天元甘露液所采用的菌种，即β-D-呋喃果糖苷酶的黑曲酶菌种，经中科院微生态研究所鉴定证明亦属安全菌种。低聚果糖作为功能性配料，添加到许多食品中，它们种大多数已获得颁发的保健食品证书，“竹叶青保健酒”还获得科技成果进步奖。