低聚异麦芽糖有上述许多优良的性质和保健生理功能，适合代替部分蔗糖，添加到各种饮料、食品中，例如：

饮料：碳酸饮料、豆奶饮料、果汁饮料、蔬菜汁饮料、茶饮料、营养饮料、补铁、补钙、补碘饮料、酒精饮料、咖啡、可可、粉末饮料等。

乳制品：牛乳、调味乳、发酵乳、乳酸菌饮料，以及各种奶粉。

糖果糕饼：各种软糖、硬糖、高粱饴、牛皮糖、巧克力、各种饼干、各式西点、羊羹、月饼、汤团馅以及各种饼馅。

甜点心：布丁、凝胶食品等

冷饮品：各式雪糕、冰棒、冰淇淋等。

焙烤食品：面包、蛋糕等。

此外，还可作为畜肉加工品、水产制品、果酱油、蜂蜜加工品等的配料。

低聚异麦芽糖既可以添加于各类食品中，也可以直接食用。因为有些食品添加低聚异麦芽糖只是为了寻求一个卖点，少量添加或根本不添加便大肆渲染，“该产品富含双歧因子”，致使广大消费者误认为低聚异麦芽糖效果不明显。实践证明，低聚异麦芽糖的效果是非常的，其最方便、、又最便于控制的方法是直接食用。直接食用时，既可用水冲饮，也可添加在稀饭等食物中。