调节微生态

在酸性条件下，壳寡糖分子中的游离氨基质子化，质子化按能与细菌带正电的细胞膜作用，干扰细菌细胞膜功能，造成细菌体内细胞质流失，对真菌和微生物的生长有。 其活性与菌种和浓度有关，且随浓度加大其活性增强，高浓度时有杀菌作用。

甲壳低聚糖是BF的一种重要种类，它能调节动物内微生物的代谢活动，改善微生物区系分布，促进双歧杆菌生长繁殖，从而，使内pH下降，抑制有害菌生长，产生B族维生素，分解，，增进蛋白质吸收。

改善组织形态

提高动物的生产性能壳寡糖使回肠微绒毛密度增加，同时也有变细、变高的倾向。 微绒毛高度增加，密度加大，利于增大小肠的吸收面积，促进营养物质的吸收，提高饲料的利用率。